Na zaměstnance v pracovním poměru se vztahuje ochrana, kdy jim zaměstnavatel v této době nemůže dát „standardní“ výpověď (důvody pro výpověď ze strany zaměstnavatele v době pracovní neschopnosti jsou poměrně striktně omezené a týkají se specifických situací, jako je například zánik zaměstnavatele, nebo jeho části apod.). Tato ochrana se ale nevztahuje na možnost ukončení pracovního poměru během neschopenky ze strany zaměstnance, ukončení pracovního poměru dohodou, nebo právě situace, kdy je pracovní poměr sjednán na dobu určitou, kdy smlouva zaniká k datu, který v ní byl dojednán.
Ukončením pracovního poměru na dobu určitou, během pracovní neschopnosti, se pro vás ale bezprostředně nic nemění. Pokud i nadále vaše pracovní neschopnost trvá, máte i nadále nárok na nemocenské dávky ve stejné výši jako doposud, a to až do konce pracovní neschopnosti, nebo do vyčerpání podpůrčí doby (standardně to bývá 380 dní od zahájení pracovní neschopnosti).